Alors qu’une sorcière redoutable s’apprête à les anéantir, Homura intervient in extremis pour sauver Madoka, Kyôko et Sayaka. Mais la stupeur s’empare des jeunes filles lorsqu’elles découvrent que cette dernière a sombré dans les méandres de la folie. Refusant de l’abandonner à son sort, Kyôko s’engage dans un face-à-face, dans l’espoir de raviver un sursaut d’humanité. Pendant ce temps, Homura élabore une stratégie désespérée : affronter seule la Nuit de Walpurgis, afin d’épargner Madoka du funeste destin qui menace de s’abattre sur elle.