À l’aube de ses 14 ans, Madoka Kaname mène une existence paisible, bercée par l’affection de sa famille et de ses proches. Cette tranquillité vole néanmoins en éclats lorsqu’elle rencontre Kyubey, une mystérieuse créature, qui lui propose d’exaucer un vœu en et de la transformer en « Puella Magi », une chasseuse de sorcières. Cependant, sa nouvelle camarade de classe, Homura Akemi, tente par tous les moyens de la dissuader de nouer ce contrat. Se pourrait-il que, derrière cette offre anodine, se dissimule une vérité des plus glaçantes ?